More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1985 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  99.7 
 
 		 334 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  99.4 
 
 		 334 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 334 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  99.7 
 
 		 334 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  99.4 
 
 		 334 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  73.05 
 
 		 334 aa  504  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01095  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0362811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  79.04 
 
 		 334 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000249721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1221  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2225  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000129004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1478  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000175371  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2502  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0601626  unclonable  0.0000000133067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1220  DNA polymerase III subunit delta'  78.74 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01103  hypothetical protein  78.74 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2028  DNA polymerase III subunit delta'  78.14 
 
 		 334 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000033373  hitchhiker  0.00000172568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  57.47 
 
 		 336 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  56.82 
 
 		 336 aa  340  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  56.76 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  51.94 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  51.47 
 
 		 340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  51.47 
 
 		 340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.72 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  55.25 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  39.76 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  34.91 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  33.75 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.02 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  36.74 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.96 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.43 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  40.31 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  30.65 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.42 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  32.19 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  29.11 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  29.11 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.48 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  39.02 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  31.49 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.12 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  39.6 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  32.65 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  32.36 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  32.11 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.55 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  31.8 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  29.45 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.77 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.89 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1983  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258403  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.62 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.77 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.93 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.09 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.22 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.87 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.88 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.4 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.97 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  41.8 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.64 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  33.64 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  33 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.75 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  32.02 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  35.59 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2239  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.56 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.88 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.58 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.55 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.18 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.73 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.09 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.22 
 
 		 681 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.88 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.38 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  40.12 
 
 		 404 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.11 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>