More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0155 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0157  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0155  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  32.97 
 
 
272 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  33.33 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1943  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.76 
 
 
346 aa  89.7  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0406245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.22 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.17 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.75 
 
 
570 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.35 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.35 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.35 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.42 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  42.35 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.19 
 
 
562 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.63 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.38 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.3 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.06 
 
 
589 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.4 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.99 
 
 
567 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.94 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.88 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  27.22 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  37.08 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  31.11 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.77 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.62 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.09 
 
 
578 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.95 
 
 
569 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.05 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.95 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.51 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.71 
 
 
554 aa  68.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.36 
 
 
600 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.71 
 
 
550 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.38 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.53 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.53 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  38.14 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.41 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  29.45 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.98 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.01 
 
 
621 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  39.76 
 
 
629 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  48 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.96 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.7 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  31.01 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.48 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  41.05 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0377  hypothetical protein  28.09 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.89 
 
 
663 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  29.11 
 
 
614 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0099  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 
603 aa  65.1  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.02 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  36.96 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  36.56 
 
 
418 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 
625 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.12 
 
 
501 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.7 
 
 
594 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.08 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.52 
 
 
601 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.76 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.2 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.95 
 
 
496 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.78 
 
 
548 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.23 
 
 
648 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  40 
 
 
650 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.43 
 
 
664 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  37.08 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.82 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  28.02 
 
 
652 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.45 
 
 
584 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.23 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.37 
 
 
467 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.65 
 
 
595 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
732 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.38 
 
 
602 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.52 
 
 
601 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.23 
 
 
730 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.96 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.1 
 
 
606 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  47.22 
 
 
374 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.87 
 
 
586 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.35 
 
 
588 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>