More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1943 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1943  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
346 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0406245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0157  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.76 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0155  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.76 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  43.75 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  47.19 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.29 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  30.57 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.5 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.44 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.37 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  37.27 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.11 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.93 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.05 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  37.04 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.23 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.26 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  30.23 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.04 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.36 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  31.2 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.01 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.6 
 
 
570 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.05 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  32.46 
 
 
565 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.94 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  33 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.46 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.84 
 
 
527 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 
518 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  32.67 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  38.27 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.28 
 
 
578 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.28 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  38.27 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  38.38 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.65 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.13 
 
 
610 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.99 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  39.02 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  35.87 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  31.68 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  31.07 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.67 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.7 
 
 
562 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.31 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  32.79 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  40 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.03 
 
 
586 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  30.7 
 
 
559 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  37.04 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  31.73 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.92 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  32 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.32 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.71 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  31.68 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  37.04 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  31.68 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.59 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.19 
 
 
732 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  30.7 
 
 
579 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.54 
 
 
602 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.72 
 
 
565 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  32.97 
 
 
301 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.72 
 
 
565 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.17 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.8 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  36.14 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  36.14 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.75 
 
 
568 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  38.27 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 
390 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  38.27 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  31.62 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  32.63 
 
 
548 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.78 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  29.57 
 
 
291 aa  57  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  38.27 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.95 
 
 
595 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  31.96 
 
 
370 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>