More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0612 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  100 
 
 
322 aa  650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  39.04 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  39.04 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.26 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  30.37 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.64 
 
 
363 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.64 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.67 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  38.17 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.96 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.62 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.52 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  37.84 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.34 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.85 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  30.22 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.11 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  61.11 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.84 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.59 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  35.95 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.93 
 
 
460 aa  72.4  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.3 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.18 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.68 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.27 
 
 
588 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3328  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  38.24 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  34.67 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.05 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.72 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.29 
 
 
589 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  45.68 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  34.38 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  29.07 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 
637 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.29 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  28.95 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.83 
 
 
1137 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.45 
 
 
632 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.69 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.83 
 
 
1115 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.32 
 
 
1113 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.07 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.39 
 
 
1137 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.46 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.2 
 
 
921 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.06 
 
 
1147 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.53 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.97 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.2 
 
 
939 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.53 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  29.91 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.77 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.27 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  41.56 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  39.77 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.97 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.13 
 
 
732 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  41.56 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  30.32 
 
 
909 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.68 
 
 
957 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.03 
 
 
1002 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2802  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.2 
 
 
556 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  24.8 
 
 
401 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  47.13 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.32 
 
 
724 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  30.91 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  29.68 
 
 
955 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.03 
 
 
1040 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.07 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.2 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1943  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  37.04 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0406245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  36.7 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.03 
 
 
1045 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.86 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  29.7 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  30.81 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  30.81 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.54 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.03 
 
 
1071 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  33.57 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  35.67 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  38.38 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.87 
 
 
589 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  30.82 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  40.45 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.12 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.01 
 
 
582 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.54 
 
 
698 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.53 
 
 
667 aa  65.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.12 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.03 
 
 
948 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>