More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3328 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3328  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 		 320 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.31 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.55 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.13 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0459  DNA polymerase III subunit delta'  32.88 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  34.59 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  34.59 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  34.59 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  32.14 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.33 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  35.22 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.55 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.71 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  32.9 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  35.17 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.58 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.99 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.84 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  32.75 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  32.75 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.95 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.35 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  38.14 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  38.24 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.73 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.71 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  34.93 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.95 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.98 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  30.77 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  34.68 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.55 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.55 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  41.94 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  34.55 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.66 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  32.45 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.59 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.86 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.3 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.67 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  39.83 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.86 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  48.72 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  48.72 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.88 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  48.72 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  34.16 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.25 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  30.07 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.68 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  32.39 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.68 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.32 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.69 
 
 		 737 aa  72.8  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  49.4 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.97 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  29.68 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.76 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.64 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  33.94 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.68 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.68 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.14 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.91 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  32.3 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.4 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.89 
 
 		 735 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  31.43 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.13 
 
 		 755 aa  69.3  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  56.9 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  32.47 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  32.47 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  40.66 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.09 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.94 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.07 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.79 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  29.94 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>