More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0527 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  51.89 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  42.07 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  32.28 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  33.64 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  39.04 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  40.32 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  31.18 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.81 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.28 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.55 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.96 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.58 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.9 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  37.09 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.26 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.67 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.26 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  32.54 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.29 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  37.13 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.16 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  30.28 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.98 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.08 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.11 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  36.42 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.86 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.5 
 
 		 332 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.17 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.98 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.8 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.29 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.29 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.76 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  34.69 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.58 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.8 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.92 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.64 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  33.97 
 
 		 499 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.92 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.37 
 
 		 421 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  34.48 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.26 
 
 		 589 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  33.99 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2239  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.72 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.54 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.6 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  30.39 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.05 
 
 		 635 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 		 565 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.37 
 
 		 550 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 		 565 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.33 
 
 		 568 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  36.08 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.08 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.83 
 
 		 622 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.68 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  31.41 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.11 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.01 
 
 		 562 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  30.73 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.48 
 
 		 478 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.05 
 
 		 390 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  37.41 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.48 
 
 		 478 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26 
 
 		 547 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.91 
 
 		 406 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 		 383 aa  85.5  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  28.7 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  26.44 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.05 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.13 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.93 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1405  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.41 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.989763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.69 
 
 		 755 aa  83.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>