More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4543 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 390 aa  759    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  59.9 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  62.44 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  61.07 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  60.46 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  55.05 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  53.09 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.47 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.05 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  59.02 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  52.02 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  51.66 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  50.76 
 
 		 389 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.66 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  53.28 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  47.81 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.41 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.3 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  50.9 
 
 		 380 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.29 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.31 
 
 		 424 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  52.43 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  50.77 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  50.77 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  51.03 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  52.3 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  52.54 
 
 		 407 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  51.54 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  51.15 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.64 
 
 		 406 aa  312  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.55 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  53.27 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  52.8 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  46.98 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  50.13 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  46.56 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  37.56 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  35.18 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.76 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  32.11 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.52 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.8 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.35 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  29.74 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.21 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.53 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.46 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.68 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.94 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.66 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.55 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.77 
 
 		 329 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.12 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  26.72 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  26.72 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  25.51 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  26.58 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  25.26 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  26.46 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  34.57 
 
 		 579 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  26.19 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  26.46 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  26.46 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.61 
 
 		 344 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.92 
 
 		 562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.26 
 
 		 588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.68 
 
 		 562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.41 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.92 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.17 
 
 		 562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  26.25 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.7 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.04 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.98 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.04 
 
 		 584 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.59 
 
 		 320 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  32.16 
 
 		 801 aa  112  8.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.76 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.11 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.98 
 
 		 595 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  35.71 
 
 		 796 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.62 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 		 625 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.04 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.1 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.95 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.86 
 
 		 520 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.4 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.41 
 
 		 559 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.88 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.87 
 
 		 641 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.18 
 
 		 690 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>