More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0843 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
389 aa  776    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  66.39 
 
 
427 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  55.44 
 
 
406 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  55.01 
 
 
412 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.53 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  54.29 
 
 
399 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.03 
 
 
431 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.64 
 
 
386 aa  362  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  52.82 
 
 
390 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  50.89 
 
 
402 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  50.63 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  50.63 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  51.26 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  52.48 
 
 
407 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  52.37 
 
 
401 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  52.82 
 
 
390 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  52.32 
 
 
394 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.13 
 
 
406 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  50.52 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  51.31 
 
 
378 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  51.28 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.52 
 
 
378 aa  325  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.76 
 
 
390 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  47.64 
 
 
385 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.65 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  51.47 
 
 
418 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  49.61 
 
 
392 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  47.7 
 
 
387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  48.79 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  46.67 
 
 
380 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.93 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.56 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  45.88 
 
 
385 aa  258  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  44.85 
 
 
394 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  44.68 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  41.82 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  36.95 
 
 
383 aa  216  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  32.24 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  29.26 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.08 
 
 
321 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.29 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.58 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.55 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.67 
 
 
335 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.53 
 
 
389 aa  124  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.79 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.4 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.85 
 
 
558 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  36.26 
 
 
548 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.96 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.1 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.25 
 
 
562 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.71 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  36.07 
 
 
595 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  33 
 
 
322 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.38 
 
 
553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.51 
 
 
517 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.02 
 
 
604 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  25.32 
 
 
339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.85 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 
580 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  35.65 
 
 
650 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.02 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  36.61 
 
 
579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.67 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.23 
 
 
588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.79 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  28.86 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.43 
 
 
698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.35 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  38.2 
 
 
537 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.5 
 
 
582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.74 
 
 
327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.75 
 
 
627 aa  113  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.56 
 
 
562 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.79 
 
 
681 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  32.08 
 
 
429 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 
625 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  30.24 
 
 
326 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.04 
 
 
338 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.54 
 
 
562 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 
462 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.97 
 
 
735 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  31.67 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.43 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.47 
 
 
591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.54 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.93 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  36.07 
 
 
586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.91 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.33 
 
 
715 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  34.78 
 
 
572 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>