More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  100 
 
 		 394 aa  776    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.55 
 
 		 378 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  52.67 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  51.32 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  48.19 
 
 		 385 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.66 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  50.66 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  50.26 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  50.53 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.68 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  45.88 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  47.18 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.47 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  48.18 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  46.89 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  42.82 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.04 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  44.85 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  45.58 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 412 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  44.05 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.42 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  41.01 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  41.01 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  41.01 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.56 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  39.74 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  44.04 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  42.75 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  45.92 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.54 
 
 		 431 aa  252  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.12 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.15 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  41.51 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  40.83 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  35.88 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.32 
 
 		 329 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 335 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.54 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.58 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  35.5 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.01 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.47 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.76 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0571  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.98 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.337724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.25 
 
 		 510 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.48 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.48 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  35.03 
 
 		 690 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.12 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  32.6 
 
 		 801 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.26 
 
 		 712 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.52 
 
 		 930 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.2 
 
 		 715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.71 
 
 		 588 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.86 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.96 
 
 		 855 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.99 
 
 		 796 aa  109  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.14 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.69 
 
 		 729 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  28.61 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.71 
 
 		 737 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  34.34 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.5 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.68 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  36.47 
 
 		 900 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.74 
 
 		 678 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.62 
 
 		 732 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  31.84 
 
 		 579 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.79 
 
 		 960 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.62 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.22 
 
 		 635 aa  107  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.36 
 
 		 595 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.96 
 
 		 812 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.52 
 
 		 914 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.79 
 
 		 322 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.57 
 
 		 688 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 727 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.26 
 
 		 841 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  34.95 
 
 		 652 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.89 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.46 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.85 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1328  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, programmed frameshift  34.59 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.79 
 
 		 554 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  27.35 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.83 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.95 
 
 		 553 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.87 
 
 		 755 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.75 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.68 
 
 		 723 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.52 
 
 		 713 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.14 
 
 		 589 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>