More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0355 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 381 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  76.44 
 
 		 378 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  72.18 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  61.62 
 
 		 385 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  67.01 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  65.97 
 
 		 392 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  60.31 
 
 		 387 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  59.53 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  54.57 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  52.21 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  54.62 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  51.39 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  49.23 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  48.72 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.66 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  49.74 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.04 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.87 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  49.35 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  50.66 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.34 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  44.85 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  55.15 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  46.95 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.2 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  46.11 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  45.78 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.18 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  44.29 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  44.29 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  44.29 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  43.42 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  44.57 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.14 
 
 		 442 aa  252  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  44.23 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  45.65 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.01 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  40.15 
 
 		 392 aa  232  6e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.24 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  29.24 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.19 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.22 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  26.33 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.7 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.06 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.48 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.34 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.61 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.98 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.35 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.18 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.21 
 
 		 501 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.52 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.43 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.95 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  34.76 
 
 		 605 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.21 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.94 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  22.58 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.61 
 
 		 678 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.02 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.31 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.61 
 
 		 679 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.06 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  31.38 
 
 		 801 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  24.16 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.21 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.96 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.84 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.08 
 
 		 732 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.37 
 
 		 729 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.23 
 
 		 715 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.35 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.34 
 
 		 732 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  42.96 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.88 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.82 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.3 
 
 		 690 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.84 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.93 
 
 		 930 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.57 
 
 		 737 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  42.96 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.44 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 		 312 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 		 701 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.9 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.88 
 
 		 589 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 		 737 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.71 
 
 		 616 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.71 
 
 		 616 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.71 
 
 		 618 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 713 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.91 
 
 		 712 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>