More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8400 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
395 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.15 
 
 
378 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.21 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  55.05 
 
 
390 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  49.5 
 
 
404 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  51.65 
 
 
390 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  49.48 
 
 
378 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  48.05 
 
 
385 aa  328  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  52.88 
 
 
389 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  49.37 
 
 
390 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  50.77 
 
 
392 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  51.37 
 
 
394 aa  325  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  56.95 
 
 
427 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  47.25 
 
 
402 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  47.25 
 
 
402 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  47.75 
 
 
393 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.3 
 
 
386 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  48.88 
 
 
407 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  48.75 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  47.25 
 
 
402 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.5 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.87 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.21 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  56.37 
 
 
424 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  47.01 
 
 
387 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.27 
 
 
406 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  47.61 
 
 
412 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  47.01 
 
 
380 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.41 
 
 
442 aa  293  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  49.36 
 
 
385 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  45.76 
 
 
394 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  48.92 
 
 
418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  49.74 
 
 
414 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  48.18 
 
 
394 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  46.67 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  36.57 
 
 
383 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  33.17 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.21 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.24 
 
 
330 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.38 
 
 
383 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.45 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.56 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.53 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.94 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.47 
 
 
321 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  32.43 
 
 
339 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  37.42 
 
 
579 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.38 
 
 
421 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.09 
 
 
332 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  36.2 
 
 
586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.75 
 
 
595 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.73 
 
 
517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.07 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.66 
 
 
641 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.58 
 
 
584 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.36 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.22 
 
 
559 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.72 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  27.44 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.91 
 
 
339 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.34 
 
 
501 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.17 
 
 
485 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 
298 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.25 
 
 
562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.72 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  33.04 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.25 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  35.8 
 
 
625 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.04 
 
 
578 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.81 
 
 
737 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  35.76 
 
 
565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.76 
 
 
565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  36.25 
 
 
559 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  27.38 
 
 
382 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.93 
 
 
338 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.27 
 
 
327 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 
363 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.81 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.64 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.43 
 
 
637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.83 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.47 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.71 
 
 
724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
588 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.82 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.81 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.23 
 
 
648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.83 
 
 
650 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  34.76 
 
 
614 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.76 
 
 
812 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.52 
 
 
509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.14 
 
 
735 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.02 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.54 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.04 
 
 
562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.52 
 
 
509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30 
 
 
565 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>