More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0662 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  100 
 
 		 385 aa  744    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  68.32 
 
 		 378 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  67.8 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  67.53 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  55.79 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  56.02 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  57.33 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  60.68 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  52.97 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  50.53 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  49.36 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  50.81 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  47.46 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  47.3 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.03 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.97 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  42.86 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  45.9 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  47.69 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.64 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  45.62 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  44.56 
 
 		 404 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  42.49 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  45.62 
 
 		 412 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  42.24 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  42.24 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.11 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  43.97 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 		 399 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.86 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.48 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.14 
 
 		 431 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.53 
 
 		 424 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  43.58 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.05 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  42.74 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  42.79 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  35.97 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.91 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.05 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.69 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.46 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.99 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.82 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.01 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  24.61 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.02 
 
 		 329 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  35.76 
 
 		 298 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.81 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.51 
 
 		 588 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.54 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.26 
 
 		 320 aa  97.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  32.73 
 
 		 807 aa  96.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.18 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  36.42 
 
 		 604 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.07 
 
 		 320 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  33.46 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  37.95 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.49 
 
 		 732 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  32.68 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.78 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.96 
 
 		 589 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.36 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.56 
 
 		 586 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.52 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  29.41 
 
 		 579 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.14 
 
 		 553 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.53 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.14 
 
 		 735 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.06 
 
 		 584 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.76 
 
 		 572 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.76 
 
 		 572 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.22 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.81 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  25.98 
 
 		 321 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.93 
 
 		 900 aa  93.2  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.54 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 		 625 aa  93.2  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.07 
 
 		 320 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.96 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.39 
 
 		 323 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  32.84 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.54 
 
 		 335 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 		 589 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.12 
 
 		 930 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 755 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  35.33 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.89 
 
 		 602 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  34.43 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.64 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.68 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.57 
 
 		 752 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.03 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.98 
 
 		 568 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>