More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0743 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 412 aa  817    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  59.7 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.25 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  55.9 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  55.01 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  56.68 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  54.94 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.4 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  56.06 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  52.93 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  52.93 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  53.18 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  54.55 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  62.98 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.1 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  52.31 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  51.79 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  51.29 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.02 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.97 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  47.44 
 
 		 378 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  47.36 
 
 		 395 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  45.6 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.95 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  45.77 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.66 
 
 		 385 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  48.26 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  45.55 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  49.6 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  48.08 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.6 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  41.41 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  44.39 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  45.36 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  44.44 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  34.53 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  30.25 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  30.18 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  26.92 
 
 		 321 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.25 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.19 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.84 
 
 		 329 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.3 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.75 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  28.78 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.33 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.65 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.49 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  32 
 
 		 548 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.98 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.82 
 
 		 332 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.57 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.82 
 
 		 560 aa  111  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 		 696 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.5 
 
 		 588 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.44 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.26 
 
 		 589 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.03 
 
 		 447 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.81 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.81 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.43 
 
 		 681 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  32.43 
 
 		 568 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.69 
 
 		 644 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.08 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.95 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.76 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  26.5 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.69 
 
 		 599 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.02 
 
 		 575 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.81 
 
 		 582 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.51 
 
 		 559 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30 
 
 		 520 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.64 
 
 		 606 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.43 
 
 		 698 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.64 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.55 
 
 		 554 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 		 537 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.87 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.33 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.14 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  34.22 
 
 		 909 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.81 
 
 		 591 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  31.72 
 
 		 715 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.48 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.61 
 
 		 930 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.81 
 
 		 565 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.69 
 
 		 716 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.81 
 
 		 565 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.62 
 
 		 518 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.9 
 
 		 690 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.02 
 
 		 724 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.91 
 
 		 807 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.83 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 667 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>