More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0307 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 418 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  74.58 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  51.94 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  49.76 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.76 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  48.92 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  49.02 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.67 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  46.45 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.15 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  48.9 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  45.81 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.8 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.09 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  47.56 
 
 		 412 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  50.24 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.64 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  46.47 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  48.92 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  47.02 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  47.02 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  47.26 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  48.79 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  48.33 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.89 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.53 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  43.72 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.19 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  43.34 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.58 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.28 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  43.03 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  43.47 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.84 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.69 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  33.82 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  31.76 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.17 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  30.29 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.81 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 		 329 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.98 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  31.92 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.58 
 
 		 520 aa  113  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.39 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.21 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.83 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.16 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  35.11 
 
 		 625 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.67 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.67 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.95 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  31.84 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.11 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.63 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.09 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.92 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 553 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.47 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.18 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30 
 
 		 634 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.92 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  31.47 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  34.57 
 
 		 614 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.97 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.67 
 
 		 567 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.39 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.08 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.57 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.39 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  27.2 
 
 		 548 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.97 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.43 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  32.49 
 
 		 801 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.96 
 
 		 616 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.31 
 
 		 618 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.96 
 
 		 616 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.15 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  34.64 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35.48 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.58 
 
 		 713 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.9 
 
 		 595 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.97 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.32 
 
 		 591 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.87 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.86 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.96 
 
 		 652 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.76 
 
 		 345 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 		 562 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  35.43 
 
 		 690 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  28.3 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>