More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5394 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  86.45 
 
 		 402 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  86.45 
 
 		 402 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  90.66 
 
 		 404 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  86.45 
 
 		 402 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 407 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  80.79 
 
 		 401 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  63.93 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  63.14 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.65 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  54.55 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  54.7 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  51.49 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.26 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.87 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  49.13 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  48.48 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  50.99 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  59.15 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  47.22 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.42 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  48.22 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.21 
 
 		 390 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  47.18 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  49.08 
 
 		 418 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.68 
 
 		 381 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  46.98 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.84 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  48.79 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  44.61 
 
 		 385 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.69 
 
 		 385 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  41.91 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  41.04 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  41.87 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  42.75 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  43.7 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  35.33 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  31.99 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.47 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.86 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.69 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.18 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.96 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.63 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.83 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.2 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.62 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.65 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.64 
 
 		 320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.49 
 
 		 340 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.51 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.46 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  32.58 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.48 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.59 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.17 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33 
 
 		 632 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 		 558 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.37 
 
 		 589 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.17 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.84 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.03 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  29.92 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.82 
 
 		 604 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.93 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.28 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.78 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.22 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.87 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  26.29 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.74 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 		 625 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  32.98 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.52 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 		 588 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.93 
 
 		 635 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.24 
 
 		 930 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.94 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  27.72 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.52 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.01 
 
 		 351 aa  99.8  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.89 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.79 
 
 		 695 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.94 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.52 
 
 		 568 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 650 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.62 
 
 		 681 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.6 
 
 		 914 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.76 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.25 
 
 		 698 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 		 537 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.42 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.42 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  31.8 
 
 		 579 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>