More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1899 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  37.4 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0157  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  33.33 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0155  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  33.33 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1943  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  47.19 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0406245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 
321 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.88 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.79 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.58 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.68 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  37.07 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  42.31 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.83 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  38.96 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  37.25 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.18 
 
 
351 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.02 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.98 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.94 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  33.59 
 
 
374 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.22 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  40.91 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  40.79 
 
 
358 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 
374 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  32.17 
 
 
381 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  40.79 
 
 
360 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  40.79 
 
 
360 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.06 
 
 
737 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
610 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.68 
 
 
724 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 
347 aa  63.5  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  44 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  35.34 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.78 
 
 
340 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 
372 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.24 
 
 
617 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.64 
 
 
344 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1971  DNA polymerase III domain-containing protein  34.38 
 
 
429 aa  62.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.56 
 
 
334 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.5 
 
 
421 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.5 
 
 
575 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
634 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  41.33 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  40.26 
 
 
396 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  52.63 
 
 
391 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  42.5 
 
 
381 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.36 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.65 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  41.33 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  44.59 
 
 
388 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  34.53 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
589 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.24 
 
 
520 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  40.23 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  25.14 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.76 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
373 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.02 
 
 
567 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.76 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
527 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.33 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.9 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  42.39 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  48.53 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.84 
 
 
559 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.27 
 
 
368 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.23 
 
 
478 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.23 
 
 
478 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.26 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.96 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  36.59 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 
304 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.73 
 
 
664 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.4 
 
 
614 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.16 
 
 
569 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
586 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.71 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.36 
 
 
501 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  33.98 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.46 
 
 
366 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  31.43 
 
 
344 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.46 
 
 
540 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.29 
 
 
305 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  41.25 
 
 
389 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
621 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>