More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1001 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  53.96 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  49.25 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  49.5 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  43.15 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  39.5 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  39.5 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  31.92 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  50 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  42.39 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  40.95 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.79 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.19 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.19 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.28 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  47.17 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.85 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  31.58 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  40 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.67 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.08 
 
 		 678 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  39.73 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  43.33 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.2 
 
 		 724 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.03 
 
 		 713 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 		 320 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 390 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 388 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  51.06 
 
 		 388 aa  52.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  33.04 
 
 		 326 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.25 
 
 		 361 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.33 
 
 		 462 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  44.83 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.63 
 
 		 358 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.94 
 
 		 737 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  31.65 
 
 		 565 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.93 
 
 		 565 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  55.1 
 
 		 354 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.82 
 
 		 421 aa  51.6  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  37.62 
 
 		 382 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 765 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2759  DNA polymerase III subunit delta'  45.07 
 
 		 307 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.91 
 
 		 1040 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.64 
 
 		 347 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.08 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  40.74 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.08 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 		 379 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2444  DNA polymerase III subunit delta'  45.07 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 652 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.03 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.58 
 
 		 690 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.7 
 
 		 382 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.28 
 
 		 621 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 358 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.67 
 
 		 634 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.83 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.63 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  30.25 
 
 		 652 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  44.68 
 
 		 390 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  35.16 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 618 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  36.62 
 
 		 418 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  47.92 
 
 		 341 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.05 
 
 		 774 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 616 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.91 
 
 		 1071 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.91 
 
 		 1045 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.13 
 
 		 578 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  47.92 
 
 		 341 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  31.03 
 
 		 390 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 616 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 643 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.91 
 
 		 1002 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  61.11 
 
 		 373 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.86 
 
 		 559 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.25 
 
 		 336 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.8 
 
 		 602 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 478 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  29.23 
 
 		 650 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 690 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.52 
 
 		 730 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 		 547 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 		 547 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  48.08 
 
 		 327 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 478 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  47.92 
 
 		 373 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  58.33 
 
 		 377 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 		 363 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.17 
 
 		 351 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 336 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.83 
 
 		 334 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  40.24 
 
 		 559 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  47.83 
 
 		 387 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.59 
 
 		 325 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.55 
 
 		 373 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>