270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1114 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  49.75 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  50.73 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  49.5 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  42.65 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  45.18 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  44.16 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  44.16 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  34.42 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  32.66 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  32.89 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  40.78 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  36.78 
 
 		 418 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.48 
 
 		 713 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  43.06 
 
 		 373 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  43.48 
 
 		 690 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.02 
 
 		 370 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.02 
 
 		 363 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.48 
 
 		 737 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.02 
 
 		 363 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.64 
 
 		 358 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.06 
 
 		 347 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.65 
 
 		 578 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.03 
 
 		 774 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.16 
 
 		 462 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.44 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.36 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  39.39 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  47.17 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  32.54 
 
 		 346 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.84 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  35.11 
 
 		 374 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  46.48 
 
 		 382 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 616 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  33.66 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 616 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 643 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 618 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 652 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  66.67 
 
 		 360 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  51.06 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  66.67 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.92 
 
 		 359 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  66.67 
 
 		 360 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 383 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.13 
 
 		 678 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  66.67 
 
 		 347 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.18 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.38 
 
 		 324 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  32.53 
 
 		 347 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 		 360 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  51.02 
 
 		 389 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 		 363 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 		 361 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 326 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  57.58 
 
 		 381 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  32.46 
 
 		 381 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.26 
 
 		 312 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  37.5 
 
 		 382 aa  48.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  57.14 
 
 		 341 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.11 
 
 		 520 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  44.23 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3018  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  37.88 
 
 		 281 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  52.63 
 
 		 349 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  57.14 
 
 		 341 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.68 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  31.48 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  55.81 
 
 		 322 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  63.64 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.27 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.33 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0793  hypothetical protein  37.96 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0073979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.85 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  45.61 
 
 		 348 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  53.06 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  57.45 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  33.68 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  48.94 
 
 		 387 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.94 
 
 		 385 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.64 
 
 		 569 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.81 
 
 		 391 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.17 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  58.33 
 
 		 389 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  40.98 
 
 		 347 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.23 
 
 		 663 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  37.35 
 
 		 272 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  55.56 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  37.23 
 
 		 650 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.13 
 
 		 878 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 765 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  37.5 
 
 		 652 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.13 
 
 		 743 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  52.78 
 
 		 394 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  57.58 
 
 		 395 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.28 
 
 		 690 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.72 
 
 		 390 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 385 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>