299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2020 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  68.14 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  53.96 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  50.73 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  44.93 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  43.14 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  43.63 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  43.14 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  40.47 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  34.65 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.17 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 351 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.17 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.94 
 
 		 363 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.94 
 
 		 370 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.27 
 
 		 363 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  42.65 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.13 
 
 		 713 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.21 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.94 
 
 		 347 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 		 349 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 678 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  48.98 
 
 		 373 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 		 330 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  46.3 
 
 		 379 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  30.56 
 
 		 360 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.57 
 
 		 812 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  42.59 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  45.1 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  48.94 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  45.1 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  39.29 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.41 
 
 		 462 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 		 389 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  50 
 
 		 368 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.63 
 
 		 652 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.75 
 
 		 347 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  47.92 
 
 		 358 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.2 
 
 		 366 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 389 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  47.92 
 
 		 360 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  47.92 
 
 		 360 aa  48.9  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  41.82 
 
 		 363 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  43.55 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0648  DNA polymerase III delta prime subunit  49.02 
 
 		 296 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  47.92 
 
 		 272 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 643 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  42.25 
 
 		 565 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  35.78 
 
 		 1159 aa  48.5  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.3 
 
 		 743 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.02 
 
 		 1202 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  42.86 
 
 		 343 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.02 
 
 		 1078 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 		 520 aa  48.5  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  32.71 
 
 		 382 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.25 
 
 		 565 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.66 
 
 		 329 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  46 
 
 		 334 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.14 
 
 		 855 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.86 
 
 		 586 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.81 
 
 		 391 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  43.64 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  27.19 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  48.84 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  50 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 774 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 834 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 		 370 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 		 322 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 		 370 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  46 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 808 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 737 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  42.86 
 
 		 579 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 		 690 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  44 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  39.13 
 
 		 690 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.86 
 
 		 584 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  48 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  38.03 
 
 		 348 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.71 
 
 		 322 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  43.42 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.19 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 618 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.94 
 
 		 338 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  43.75 
 
 		 381 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  44.23 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  36.11 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  32.05 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.9 
 
 		 637 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.59 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.68 
 
 		 878 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>