More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl675 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  100 
 
 
247 aa  480  1e-135  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0011  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.56 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.158279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  34.07 
 
 
330 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  37.4 
 
 
327 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.4 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  38.21 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  36.59 
 
 
327 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  35.2 
 
 
327 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  36.59 
 
 
327 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  41.18 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  41.18 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  41.18 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  41.18 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  41.18 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 
305 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.38 
 
 
331 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  30.29 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  35.04 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  25.71 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  32.1 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  26.09 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  30.13 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  31.37 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.88 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0123  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  30.14 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00494524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  24.61 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  26.52 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.97 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  26.92 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.59 
 
 
329 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0019  DNA polymerase III delta subunit  36.81 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  28.93 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.17 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  27.33 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.86 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.01 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.53 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  34.5 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  37.38 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.17 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.37 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.31 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.17 
 
 
602 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  23.64 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  36.84 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.06 
 
 
478 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  26 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  26.71 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.06 
 
 
478 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.77 
 
 
621 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.22 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.27 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.74 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  24.58 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  32.2 
 
 
381 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.44 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.52 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.71 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  29.8 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.23 
 
 
421 aa  65.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 
320 aa  65.1  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  46.03 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.86 
 
 
664 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 
388 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  23.81 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.38 
 
 
637 aa  65.1  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  29.56 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  27.49 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  32.14 
 
 
629 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 
363 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  37.21 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.71 
 
 
368 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 
360 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.3 
 
 
344 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  24.85 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  30.07 
 
 
499 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 
392 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  31.41 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.83 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.71 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.49 
 
 
589 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  34.04 
 
 
372 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 
322 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  22.6 
 
 
323 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  27.1 
 
 
324 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  25.32 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  32.33 
 
 
336 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  29.84 
 
 
328 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>