183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1648 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  35.53 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  35.15 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  36.1 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  35.57 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  35.57 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  32.66 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  31.43 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.84 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  39.33 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  35.87 
 
 		 379 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  55.32 
 
 		 387 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  35.63 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  35.87 
 
 		 373 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  44.68 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 389 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  42.55 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 363 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  42.55 
 
 		 332 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.75 
 
 		 569 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  46 
 
 		 323 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  42.55 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 363 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.23 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  48.94 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  34.48 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 390 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  39.19 
 
 		 382 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  36.99 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  44.68 
 
 		 351 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.92 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  48.94 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.59 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  53.19 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  41.82 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 326 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  45.1 
 
 		 354 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.36 
 
 		 360 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  48.94 
 
 		 358 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 340 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.31 
 
 		 318 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  32.76 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  48 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.15 
 
 		 327 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  48 
 
 		 341 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 		 389 aa  48.5  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.18 
 
 		 347 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.68 
 
 		 334 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  46.51 
 
 		 346 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.92 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  42.55 
 
 		 284 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  35.63 
 
 		 348 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  36.96 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 389 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.68 
 
 		 334 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  43.48 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  47.62 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  45.24 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  32.43 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  47.83 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 388 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  43.48 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  43.48 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  48.84 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  42.55 
 
 		 381 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  44.23 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0011  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.13 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.158279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  29.29 
 
 		 382 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  45.24 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  33.94 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  44.68 
 
 		 374 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.83 
 
 		 320 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 		 418 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  48.94 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.25 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  46.81 
 
 		 347 aa  45.8  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.82 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.27 
 
 		 586 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.97 
 
 		 580 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 		 713 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  39.44 
 
 		 321 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 		 390 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  46.51 
 
 		 377 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.38 
 
 		 340 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.18 
 
 		 318 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.14 
 
 		 366 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.66 
 
 		 324 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  40.43 
 
 		 347 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.16 
 
 		 584 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.29 
 
 		 565 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  50 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  31.3 
 
 		 579 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 678 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  31.94 
 
 		 396 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>