80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0671 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  49.52 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  49.52 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  49.52 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  40.47 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  36.74 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  40.37 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  34.42 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  31.92 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  31.43 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.39 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.21 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3018  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  30.77 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.73 
 
 		 354 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  36.36 
 
 		 323 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  32.43 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.82 
 
 		 363 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.82 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.82 
 
 		 370 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  42.42 
 
 		 382 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 395 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  42 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 388 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  57.89 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 418 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1938  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  36.36 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  48.98 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  32.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.38 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  51.28 
 
 		 389 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.83 
 
 		 320 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2267  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  38.78 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.29 
 
 		 327 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.53 
 
 		 338 aa  45.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 326 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0184  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  33.85 
 
 		 320 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 		 284 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 		 358 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35.94 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.17 
 
 		 567 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  29.17 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.3 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  26.61 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  35.71 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  43.14 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  45.1 
 
 		 389 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0648  DNA polymerase III delta prime subunit  41.51 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0793  hypothetical protein  60 
 
 		 348 aa  43.5  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0073979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  34.74 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.74 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  50 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 		 389 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0431  Hedgehog/intein hint domain protein  31.03 
 
 		 1232 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.940006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.68 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  31.63 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  44.68 
 
 		 358 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  30.53 
 
 		 394 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 342 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 342 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  33.85 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0491  DNA polymerase III gamma/tau subunit  37.74 
 
 		 375 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1971  DNA polymerase III domain-containing protein  42.55 
 
 		 429 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 390 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  44.68 
 
 		 360 aa  42  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.89 
 
 		 682 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 		 389 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  44.68 
 
 		 360 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  39.62 
 
 		 336 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  40.38 
 
 		 336 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 344 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 318 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.46 
 
 		 359 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>