More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3018 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3018  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  100 
 
 
281 aa  553  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  51.69 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0184  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  47.14 
 
 
320 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  44.78 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1938  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  46.76 
 
 
321 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2267  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  38.87 
 
 
313 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.28 
 
 
324 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 
312 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.62 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  28.18 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  37.12 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.64 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  31.41 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  34.34 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  39.55 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.89 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  39.55 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.9 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.88 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.1 
 
 
724 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  30.99 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  38.81 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  35.9 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.14 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.63 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  29.07 
 
 
559 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.66 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.55 
 
 
560 aa  73.2  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  25.32 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.71 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  42.28 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  28.05 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.82 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.92 
 
 
610 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.79 
 
 
562 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  36.36 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.13 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.13 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.06 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.52 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  32.71 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.09 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  30.14 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  41 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.33 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.08 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  34.85 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.35 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.35 
 
 
562 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.93 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  32.91 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.16 
 
 
737 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.33 
 
 
562 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.59 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.66 
 
 
612 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.54 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.85 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.01 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.01 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  32.72 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  32.71 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.53 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  36.57 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  27.18 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.77 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.59 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0123  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  39.13 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00494524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.74 
 
 
602 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.03 
 
 
565 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.45 
 
 
398 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.03 
 
 
565 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  38.33 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.69 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.69 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.83 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  38.33 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  27.18 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  29.93 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.45 
 
 
385 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>