More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0123 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0123  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
312 aa  623  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00494524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  48.25 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  26.46 
 
 
337 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  41.01 
 
 
304 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  26.71 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  26.71 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  26.4 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  26.4 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  26.4 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  27.55 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  27.24 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  26.09 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.62 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  26.56 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  38.73 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  36 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.62 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  26.56 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  25.16 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  26.96 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.72 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.92 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  33.11 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  34.36 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  34.36 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.16 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.75 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.76 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.47 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.76 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  33.54 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  27.58 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  28.3 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.49 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.03 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.62 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  27.33 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.66 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  26.93 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.66 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.11 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.42 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.05 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.66 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.66 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.24 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 
326 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.48 
 
 
338 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.07 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.71 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.77 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.42 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  35.67 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.47 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.82 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.82 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.87 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.48 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  35.37 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  35.37 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  35.37 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.48 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.69 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  35.07 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.85 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.64 
 
 
580 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  35.25 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  30.14 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.58 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  30.22 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  32.84 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  27.27 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.93 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.16 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.56 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.52 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.39 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.23 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  37.91 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  34.84 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  31.97 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>