More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0184 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0184  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  100 
 
 
320 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  54.39 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1938  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  47.68 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3018  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  47.14 
 
 
281 aa  212  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  43.55 
 
 
286 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2267  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  38.51 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  42.75 
 
 
284 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.34 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.21 
 
 
614 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.24 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  32.95 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.57 
 
 
724 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  38.39 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.77 
 
 
551 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.82 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.58 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  31.58 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  38.17 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.86 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.17 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  33.84 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.43 
 
 
538 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 
579 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.16 
 
 
570 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.29 
 
 
622 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.36 
 
 
562 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.04 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  31.01 
 
 
629 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.19 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  31.88 
 
 
559 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  33.13 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.56 
 
 
688 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.62 
 
 
641 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.17 
 
 
562 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.23 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  32.39 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 
579 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 
582 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.65 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.65 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  26.05 
 
 
582 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 
582 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  33.99 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  31.73 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.54 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.55 
 
 
698 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.05 
 
 
610 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.25 
 
 
737 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  33.52 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  33.52 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  37.4 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  33.52 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  34.11 
 
 
577 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.55 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  35.44 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2144  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.85 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.65 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  34.38 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  35.37 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  32.96 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  27.22 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.39 
 
 
570 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.16 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.17 
 
 
559 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.29 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  35.58 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.88 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.54 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.54 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.33 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.71 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  38.78 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  34.92 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.15 
 
 
565 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.15 
 
 
565 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.15 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  30.65 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.11 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  31.87 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>