158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1085 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1085  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.85483  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0612  DNA polymerase III subunit delta'  97.99 
 
 		 199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0687  DNA polymerase III subunit delta'  97.99 
 
 		 199 aa  354  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.714186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0671  DNA polymerase III subunit delta'  49.52 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.737257  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1568  DNA polymerase III subunit delta'  48.02 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2020  DNA polymerase III subunit delta'  43.63 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1114  DNA polymerase III subunit delta'  45.18 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000153655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1375  putative DNA polymerase III delta prime subunit HolB  42.42 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000928003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1001  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1648  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00316368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.9 
 
 		 363 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.9 
 
 		 370 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 678 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.9 
 
 		 363 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 637 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.17 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.94 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  40 
 
 		 296 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  40.54 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.07 
 
 		 326 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 370 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 370 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  52.17 
 
 		 373 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 		 713 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.29 
 
 		 812 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  52.94 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.23 
 
 		 359 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  36.9 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  35.8 
 
 		 418 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 		 462 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  30 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  35.14 
 
 		 373 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  35.87 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 841 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  44.9 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  28.57 
 
 		 650 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.38 
 
 		 334 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 729 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1938  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  42.31 
 
 		 321 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 808 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 834 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.31 
 
 		 334 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 727 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  46.15 
 
 		 360 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  51.06 
 
 		 326 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  54.29 
 
 		 351 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.7 
 
 		 383 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  46.15 
 
 		 360 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  46.15 
 
 		 358 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  44.9 
 
 		 341 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 692 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 347 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0612  DNA polymerase III delta' subunit  35 
 
 		 322 aa  45.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.15 
 
 		 322 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.88 
 
 		 1122 aa  45.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.73 
 
 		 391 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 373 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  46.81 
 
 		 387 aa  44.7  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  45.83 
 
 		 312 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.86 
 
 		 855 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  46.81 
 
 		 323 aa  44.7  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 715 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 774 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  35.21 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.53 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.06 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  35.06 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  44.68 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  44.83 
 
 		 382 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 737 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.55 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0648  DNA polymerase III delta prime subunit  51.43 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  42.86 
 
 		 343 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 		 394 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  48.94 
 
 		 381 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.33 
 
 		 690 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.43 
 
 		 1159 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2267  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  44.23 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  47.83 
 
 		 389 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.1 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35.94 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  36.9 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  46.94 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  36.9 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 1078 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  36.9 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.67 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  48.57 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 1202 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  36.9 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  36.9 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  30.91 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  48.98 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  46.94 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  47.83 
 
 		 389 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 690 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>