More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0985 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
382 aa  791    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  58.12 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  53.7 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0875  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  38.86 
 
 
379 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6089  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.51 
 
 
371 aa  258  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3272  DNA polymerase III gamma/tau subunit  34.03 
 
 
372 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  34.37 
 
 
382 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0491  DNA polymerase III gamma/tau subunit  33.25 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0932  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  33.42 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.1978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0634  hypothetical protein  34.21 
 
 
381 aa  220  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.4 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.18 
 
 
320 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.56 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.1 
 
 
331 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.39 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.97 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.58 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.24 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.66 
 
 
318 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  25.99 
 
 
389 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 
390 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.67 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.55 
 
 
358 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 
390 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  31.23 
 
 
389 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  27.38 
 
 
395 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.8 
 
 
383 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  25.37 
 
 
388 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 
388 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.6 
 
 
320 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.86 
 
 
320 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.29 
 
 
363 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  31.11 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.89 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  28.51 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.35 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.4 
 
 
324 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.07 
 
 
373 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.78 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.97 
 
 
326 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.48 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.74 
 
 
735 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  28.23 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  27.12 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  24.21 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.33 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  24 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.51 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  29.51 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.92 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  23.43 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  29.1 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  28.23 
 
 
321 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  28.16 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  24.22 
 
 
320 aa  89.7  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 
344 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  24.25 
 
 
796 aa  89.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.8 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.45 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.29 
 
 
354 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.14 
 
 
737 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.28 
 
 
325 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  26.75 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.44 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  30.28 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.95 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.83 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.83 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.83 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.83 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.48 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  26.72 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.83 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  27.73 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.73 
 
 
322 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.34 
 
 
335 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.28 
 
 
406 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.01 
 
 
550 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  24.88 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.97 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.15 
 
 
326 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  24.12 
 
 
1122 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.79 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  31.51 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  26.97 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.1 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.3 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.3 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.47 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  24.9 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.09 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  31.51 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  27.46 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  25.51 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.71 
 
 
570 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.12 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.08 
 
 
562 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  32.27 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  23.79 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>