More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2759 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2759  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
307 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2444  DNA polymerase III subunit delta'  98.7 
 
 
307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.27 
 
 
329 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.19 
 
 
324 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.84 
 
 
322 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.27 
 
 
330 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.73 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.53 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.38 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  25.7 
 
 
320 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.38 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  25.31 
 
 
337 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.08 
 
 
323 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.66 
 
 
354 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.37 
 
 
340 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.62 
 
 
358 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.37 
 
 
351 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.33 
 
 
318 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 
327 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.2 
 
 
339 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  25.94 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  31.03 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  26.73 
 
 
339 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.46 
 
 
331 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.33 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  22.85 
 
 
344 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.6 
 
 
383 aa  89  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.54 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.38 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  32.68 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  24.58 
 
 
389 aa  87  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.25 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  22.26 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  32.04 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.7 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  27.8 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  29.57 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  27.8 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  25.4 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  24.76 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  24.76 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  27.23 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  27.32 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  27.23 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  29.67 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.82 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.69 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.01 
 
 
385 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.06 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.19 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  28.81 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.26 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  24.76 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  31.1 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  24.71 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  27.23 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.53 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.88 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  28.36 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  31.9 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.11 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  27.54 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  24.14 
 
 
327 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  24.14 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  24.14 
 
 
327 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.62 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.53 
 
 
363 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  24.14 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  23.94 
 
 
807 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.15 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.32 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  25.71 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.4 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  27.53 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  35.57 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  26.01 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  20.44 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  25.08 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  23.51 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  25.55 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  25.45 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  21.65 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  24.92 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.92 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.27 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.96 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.92 
 
 
735 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  26.54 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  23.2 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  25.42 
 
 
900 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.14 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  25.09 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  30.25 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  25.99 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  24.66 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6089  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  24.32 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.42 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>