More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6089 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6089  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 		 371 aa  766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3272  DNA polymerase III gamma/tau subunit  56.3 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0491  DNA polymerase III gamma/tau subunit  44.3 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0075  DNA polymerase III gamma/tau subunit  41.13 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.51 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0634  hypothetical protein  37.33 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0875  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  35.73 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0932  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  35.64 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.1978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  35.17 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  34.48 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.14 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.81 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.29 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.04 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.66 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.75 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.85 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.51 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.92 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.83 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.28 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.47 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  33.46 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  31.15 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  30.04 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.79 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.72 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.54 
 
 		 561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.91 
 
 		 737 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.54 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  33 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  29.84 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  25.63 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.3 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.23 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.06 
 
 		 621 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  32.06 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.68 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.69 
 
 		 559 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.5 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.13 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.84 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.14 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.67 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.96 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.87 
 
 		 522 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 478 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.86 
 
 		 520 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.61 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  29.39 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.05 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.23 
 
 		 641 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.61 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.72 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.09 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  25.55 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.87 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.8 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  25 
 
 		 568 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.03 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.53 
 
 		 324 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  27.8 
 
 		 312 aa  99.8  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.24 
 
 		 602 aa  99.4  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  31.4 
 
 		 342 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  31.4 
 
 		 336 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.8 
 
 		 554 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.4 
 
 		 599 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.56 
 
 		 589 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.77 
 
 		 562 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  32.06 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.74 
 
 		 518 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  29.6 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.69 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  29.6 
 
 		 605 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  32.27 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  33.7 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  33.15 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.48 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  33.15 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.38 
 
 		 562 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  33.15 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  30.13 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.31 
 
 		 562 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.65 
 
 		 1078 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  31 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  25.86 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>