More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1509 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 350 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  63.4 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  64.22 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  64.52 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  62.36 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  65.01 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  46.27 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  45.45 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  41.34 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  45.37 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  44.67 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  43.49 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  41.28 
 
 		 364 aa  212  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  46.27 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  46.21 
 
 		 373 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  43.32 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  38.62 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  36.81 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  44.6 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  44.44 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  38.72 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.65 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  37.58 
 
 		 354 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  36.64 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  36.64 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  31.21 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  42.28 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.9 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  42.31 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  37.04 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.46 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  42.36 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  42.81 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.69 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  42.91 
 
 		 374 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.3 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  47.03 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.77 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.63 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  41.42 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  42.6 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.6 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.97 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  35.06 
 
 		 605 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 529 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.06 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.42 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.85 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.47 
 
 		 520 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  33.05 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.35 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.03 
 
 		 751 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.5 
 
 		 914 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.35 
 
 		 543 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  28.98 
 
 		 537 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.55 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  26.73 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  31.15 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.44 
 
 		 427 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.38 
 
 		 685 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  31.15 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.43 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  30.13 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  30.38 
 
 		 631 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.25 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.34 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.82 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  39.88 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  40.62 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  20.6 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.11 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.99 
 
 		 601 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.06 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.42 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.39 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  32.56 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.11 
 
 		 701 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.56 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.11 
 
 		 681 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.32 
 
 		 558 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  28.69 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.09 
 
 		 723 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.84 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  23.89 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.94 
 
 		 628 aa  89.7  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.44 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  29.33 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.37 
 
 		 553 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.58 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 517 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.16 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>