More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5515 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  37.37 
 
 
317 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  37.26 
 
 
319 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  41.6 
 
 
311 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  37.26 
 
 
319 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  37.62 
 
 
319 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  37.72 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  37.42 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  35.74 
 
 
320 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.37 
 
 
325 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  36.39 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
326 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  34.39 
 
 
314 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  32.87 
 
 
318 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  32.7 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  32.76 
 
 
325 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  33.22 
 
 
319 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  31.96 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.41 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  30.1 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  35.53 
 
 
374 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  28.4 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  28.4 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.97 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 
323 aa  89.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  33.05 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  32.34 
 
 
358 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  34.2 
 
 
370 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.74 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  33.68 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.79 
 
 
538 aa  85.5  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  32.3 
 
 
631 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  32.7 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.89 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.3 
 
 
685 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  29.12 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.61 
 
 
751 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  32.42 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.87 
 
 
622 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.34 
 
 
578 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.33 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  29.95 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  34.18 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.93 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.78 
 
 
730 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2802  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.04 
 
 
556 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30 
 
 
529 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.04 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.78 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  29.39 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.7 
 
 
572 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.89 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.7 
 
 
572 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0232  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.97 
 
 
554 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.07 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.03 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.65 
 
 
320 aa  79  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  29.26 
 
 
381 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
736 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  32.62 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  33.78 
 
 
650 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.16 
 
 
723 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  28.5 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
691 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
689 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.94 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 
743 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
692 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
696 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.3 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.84 
 
 
695 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.88 
 
 
687 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.38 
 
 
602 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.07 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  33.55 
 
 
577 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  31.48 
 
 
580 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.57 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.94 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.16 
 
 
553 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  31.16 
 
 
648 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.16 
 
 
692 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  32.61 
 
 
537 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  29.28 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 
701 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.2 
 
 
650 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32 
 
 
460 aa  76.3  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.14 
 
 
635 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 
681 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.78 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  27.76 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.61 
 
 
755 aa  75.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.4 
 
 
613 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.43 
 
 
774 aa  75.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>