More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_01481 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  88.75 
 
 		 320 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  79.38 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  55.62 
 
 		 319 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  36.62 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  31.19 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  32.71 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  29.04 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  29.18 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  30.39 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  30.92 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  30.23 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  30.23 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  27.56 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  30.15 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.34 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  28.01 
 
 		 317 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  27.87 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.67 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.13 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  31.96 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.04 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.78 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.87 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.99 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  35.98 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.08 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 365 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.98 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.44 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.81 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.85 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.67 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.04 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.85 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.04 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.61 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.89 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  31.55 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.68 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.7 
 
 		 373 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.87 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.79 
 
 		 737 aa  86.3  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.45 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.23 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  22.18 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  27.96 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.38 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.87 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.73 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.67 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  30.5 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.95 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.27 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.5 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.5 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  30.57 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  31.79 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  31.79 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  31.79 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.01 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  31.79 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  31.79 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.06 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.27 
 
 		 562 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  32.7 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.13 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  33.69 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.17 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  26.79 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.72 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  27.6 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  28.79 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.82 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.85 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  28.79 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.1 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.89 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.89 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.88 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.88 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.88 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.69 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  26.87 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>