More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0131 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 319 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  79.38 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  79.69 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  58.01 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  37.12 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  37.12 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  35.97 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  30.34 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  29.7 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  27.54 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  32.03 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  31.15 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  27.04 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  30.41 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  29.55 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.66 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  27.99 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  30.29 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  27.39 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  30.1 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.15 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.56 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.41 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  34.59 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.98 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.63 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  35.14 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.54 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.89 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.6 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.89 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.57 
 
 		 737 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  31.87 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  34.08 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.78 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.34 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.45 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  30.12 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  25.35 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.17 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  27.73 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.73 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  25.07 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  24.87 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  29.03 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  29.01 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.37 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.33 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  29.24 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  29.49 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.84 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.88 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.93 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.91 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.2 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.65 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.63 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  27.56 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.19 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  28.04 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  28.04 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  28.04 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  28.42 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.7 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  25 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.52 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.47 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.52 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  28.71 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.41 
 
 		 641 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  29.82 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.57 
 
 		 735 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.37 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  26.2 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  27.87 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.3 
 
 		 553 aa  72.4  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>