More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2379 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 314 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  73.79 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  66.35 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  49.03 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  49.03 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  49.51 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  47.81 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  48.23 
 
 		 317 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  42.63 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  47.59 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.82 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  40.63 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  51.64 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  34.38 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  34.39 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  30.92 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  31.15 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.68 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.81 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.15 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.71 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.56 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.68 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.85 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.74 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.87 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  35.92 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  34.59 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.9 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.49 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.73 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.35 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.77 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.33 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.83 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 641 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  37.39 
 
 		 373 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.92 
 
 		 737 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.66 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.8 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  27.61 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.49 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  31.68 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.49 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  30.4 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.02 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.76 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  37.14 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  35.13 
 
 		 370 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.99 
 
 		 485 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.14 
 
 		 354 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.48 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  34.23 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  27.92 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  27.92 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.74 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  34.77 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.69 
 
 		 695 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  27.92 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  36.19 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  33.89 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.05 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  27.6 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  28.24 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  31.15 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  30.08 
 
 		 389 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  28.24 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  35.91 
 
 		 373 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  36.19 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.68 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.35 
 
 		 395 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  31.56 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.33 
 
 		 900 aa  89  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.71 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.91 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.91 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  27.91 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  31.27 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.55 
 
 		 586 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  32.02 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.05 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.25 
 
 		 589 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  33.15 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.16 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.51 
 
 		 648 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.15 
 
 		 562 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.52 
 
 		 562 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.52 
 
 		 562 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.55 
 
 		 561 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>