More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1060 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  100 
 
 
533 aa  1086    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.84 
 
 
505 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
614 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.56 
 
 
615 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.89 
 
 
611 aa  346  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.82 
 
 
592 aa  346  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.84 
 
 
613 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.63 
 
 
587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.89 
 
 
687 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
628 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
626 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.97 
 
 
600 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.89 
 
 
623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.74 
 
 
628 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.27 
 
 
580 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.05 
 
 
623 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.29 
 
 
627 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.48 
 
 
605 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.53 
 
 
659 aa  324  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.37 
 
 
624 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.93 
 
 
608 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.57 
 
 
623 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.36 
 
 
626 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
582 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.6 
 
 
602 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.78 
 
 
618 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.44 
 
 
605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.16 
 
 
631 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.81 
 
 
634 aa  320  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.21 
 
 
582 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.43 
 
 
602 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.13 
 
 
625 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.26 
 
 
622 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.51 
 
 
625 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.15 
 
 
565 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.3 
 
 
651 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.02 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.71 
 
 
605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.39 
 
 
606 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.96 
 
 
584 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.77 
 
 
573 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.05 
 
 
632 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  37.53 
 
 
605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0492  putative DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.49 
 
 
396 aa  274  3e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.13 
 
 
570 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.72 
 
 
562 aa  263  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.72 
 
 
562 aa  263  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.48 
 
 
562 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.6 
 
 
562 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.6 
 
 
562 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.6 
 
 
562 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.27 
 
 
591 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.55 
 
 
562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.29 
 
 
582 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.55 
 
 
562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  37.75 
 
 
548 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.25 
 
 
551 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 
580 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.2 
 
 
562 aa  257  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.81 
 
 
716 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.75 
 
 
562 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.2 
 
 
649 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.49 
 
 
554 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.8 
 
 
743 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.57 
 
 
692 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.83 
 
 
736 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  38.42 
 
 
537 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.48 
 
 
587 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.79 
 
 
602 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.64 
 
 
691 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.92 
 
 
694 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.87 
 
 
599 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.76 
 
 
643 aa  250  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.11 
 
 
690 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.1 
 
 
701 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.81 
 
 
582 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  35.8 
 
 
648 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.83 
 
 
582 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.95 
 
 
569 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.54 
 
 
681 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.73 
 
 
692 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.36 
 
 
642 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.24 
 
 
650 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.31 
 
 
664 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.77 
 
 
689 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.61 
 
 
579 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.7 
 
 
642 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.87 
 
 
561 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.77 
 
 
696 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.83 
 
 
687 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  37.47 
 
 
643 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>