123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1220 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  100 
 
 		 448 aa  905    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  52.95 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  54.28 
 
 		 441 aa  461  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  51.02 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  48.76 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  50.11 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  49.89 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  50.22 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  50.22 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  42.79 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  41.7 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  44.15 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  42.7 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 463 aa  359  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  42.27 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  42.73 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.01 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  41.5 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  37.03 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.38 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  27.54 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1645  UvrD/REP helicase  29.36 
 
 		 606 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.417198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 644 aa  47  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  39.47 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.96 
 
 		 639 aa  46.6  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 		 697 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.18 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.79 
 
 		 731 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.89 
 
 		 643 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.08 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.28 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  35.29 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.24 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  37.11 
 
 		 691 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.76 
 
 		 630 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.76 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  43.08 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.3 
 
 		 731 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.08 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 781 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.3 
 
 		 731 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  40.68 
 
 		 775 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.83 
 
 		 721 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  39.76 
 
 		 641 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 784 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 723 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 781 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.56 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  39.76 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.55 
 
 		 621 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.05 
 
 		 610 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 656 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.05 
 
 		 610 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.89 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.24 
 
 		 662 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  40.54 
 
 		 628 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  37.35 
 
 		 632 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 627 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 655 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.35 
 
 		 617 aa  43.9  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  34.83 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.55 
 
 		 621 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 629 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  48.72 
 
 		 1301 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  37.35 
 
 		 628 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  34.72 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.76 
 
 		 640 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.76 
 
 		 640 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  54.05 
 
 		 637 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  37.35 
 
 		 629 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  40.28 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  56.76 
 
 		 637 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  42.65 
 
 		 703 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  43.86 
 
 		 615 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  45.28 
 
 		 776 aa  43.5  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.3 
 
 		 800 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 604 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.55 
 
 		 638 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.55 
 
 		 649 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  56.76 
 
 		 667 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>