110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37582 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  74.4 
 
 		 458 aa  689    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  100 
 
 		 459 aa  923    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  65.84 
 
 		 455 aa  618  1e-176  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  67.04 
 
 		 484 aa  614  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  59.43 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  44.52 
 
 		 450 aa  362  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  42.04 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  42.48 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  43.76 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  44.15 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  42.54 
 
 		 450 aa  352  7e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  45.35 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  42.57 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  40.55 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.32 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  42.45 
 
 		 452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  43.79 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  39.2 
 
 		 451 aa  299  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 686 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  45.59 
 
 		 612 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.62 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.31 
 
 		 637 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  39.33 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.28 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 651 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.74 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.96 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.26 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.82 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  32.26 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  44.12 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.12 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  44.12 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.48 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.11 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.25 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  33.98 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.28 
 
 		 650 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  38.14 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  42.65 
 
 		 632 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  38 
 
 		 706 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.08 
 
 		 697 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 627 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.03 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.89 
 
 		 618 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  30.65 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.03 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 629 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39 
 
 		 694 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  42 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  46 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  42.65 
 
 		 629 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.03 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 629 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38 
 
 		 699 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.07 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.07 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.93 
 
 		 644 aa  43.9  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.82 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  35.11 
 
 		 658 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.79 
 
 		 650 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 646 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  40 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.79 
 
 		 657 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  35.11 
 
 		 660 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  35.04 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  41.03 
 
 		 637 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.98 
 
 		 651 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.79 
 
 		 655 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 659 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.59 
 
 		 615 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 621 aa  43.9  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01662  cell division protein FtsH  42.65 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000430091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5435  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.19 
 
 		 749 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  38.75 
 
 		 665 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37 
 
 		 801 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 616 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  37.88 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.03 
 
 		 640 aa  43.5  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 621 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  42.62 
 
 		 651 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.23 
 
 		 608 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 630 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>