More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17401 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
348 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.08 
 
 
398 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.06 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.06 
 
 
356 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.03 
 
 
347 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.67 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 
370 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.34 
 
 
375 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 
366 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.16 
 
 
352 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18071  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.59 
 
 
352 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
386 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 
360 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 
360 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.71 
 
 
366 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.3 
 
 
352 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 
371 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18041  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
352 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
342 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 
338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.52 
 
 
330 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
338 aa  350  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 
335 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 
333 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.23 
 
 
336 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
338 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
336 aa  348  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.76 
 
 
334 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.31 
 
 
335 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.13 
 
 
337 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.94 
 
 
334 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.76 
 
 
332 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
336 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  52.94 
 
 
355 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  52.26 
 
 
341 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
333 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.57 
 
 
336 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.52 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 
334 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 
334 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
338 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.49 
 
 
354 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
336 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.84 
 
 
541 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 
334 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
343 aa  341  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
336 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
336 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
333 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 
338 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.48 
 
 
351 aa  340  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.52 
 
 
334 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
340 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.23 
 
 
338 aa  340  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
333 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 
334 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
333 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.85 
 
 
336 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.89 
 
 
335 aa  340  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.84 
 
 
336 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.23 
 
 
334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 
350 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.23 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.91 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
333 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.16 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.08 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.63 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.84 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.56 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.41 
 
 
346 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.35 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.09 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.38 
 
 
346 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.91 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.23 
 
 
354 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 
334 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.94 
 
 
346 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 
349 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>