More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0835 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 375 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.24 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.35 
 
 		 371 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.75 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.67 
 
 		 386 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 		 366 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.07 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.07 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.48 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.31 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.14 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.86 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.24 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.89 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.39 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.82 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.46 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.38 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.8 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.08 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.66 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  55.68 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.44 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.04 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.34 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.63 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.5 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>