More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18251 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.48 
 
 		 352 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 352 aa  707    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18071  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.03 
 
 		 352 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18041  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.28 
 
 		 352 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.3 
 
 		 348 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.3 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.3 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.13 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.94 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.94 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.71 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.1 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.09 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.17 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.65 
 
 		 371 aa  328  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.84 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.35 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.44 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.26 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.78 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.04 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.73 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.75 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.83 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.02 
 
 		 541 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.85 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.26 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.54 
 
 		 333 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.18 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.5 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.54 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.16 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.32 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.21 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.92 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  45.83 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.71 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.93 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.46 
 
 		 334 aa  295  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.63 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.46 
 
 		 334 aa  295  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.62 
 
 		 336 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.17 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.82 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.83 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.83 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.35 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  47 
 
 		 329 aa  292  7e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.74 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.75 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.37 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.16 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.5 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.48 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.66 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.13 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.28 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  45.42 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.49 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.01 
 
 		 339 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0404  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.17 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.51 
 
 		 346 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.51 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2576  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.67 
 
 		 326 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0652542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.14 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.14 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.69 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.54 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.06 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.23 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  49 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.14 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.49 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.54 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.47 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.43 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.33 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.01 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.37 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.62 
 
 		 343 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.2 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.16 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.88 
 
 		 336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.31 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  46.08 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.77 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.74 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.31 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.87 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0922  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.49 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0472532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>