More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0319 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  95.74 
 
 
329 aa  642    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
329 aa  668    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1112  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
326 aa  462  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.729195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
342 aa  384  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
369 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 
357 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 
346 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 
347 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 
352 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
346 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
346 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 
348 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
346 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.78 
 
 
339 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
345 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
346 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 
350 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 
350 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
346 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.37 
 
 
343 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 
342 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0575  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 
331 aa  366  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 
341 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 
356 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 
356 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 
352 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 
344 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 
351 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 
348 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 
338 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 
388 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
348 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 
349 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
341 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
341 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
336 aa  358  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 
348 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 
347 aa  358  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.97 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 
341 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.1 
 
 
336 aa  354  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.06 
 
 
348 aa  354  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 
337 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 
348 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 
347 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 
344 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 
338 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.87 
 
 
353 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.85 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.97 
 
 
349 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 
337 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.12 
 
 
337 aa  352  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 
334 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.87 
 
 
357 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
357 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
357 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
337 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.97 
 
 
338 aa  351  8.999999999999999e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.09 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.09 
 
 
334 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 
333 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.52 
 
 
333 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
332 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 
338 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.23 
 
 
340 aa  350  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 
338 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.09 
 
 
334 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 
351 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.92 
 
 
541 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 
351 aa  349  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 
351 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
333 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
336 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
333 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
334 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.19 
 
 
337 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 
325 aa  349  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.09 
 
 
334 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
336 aa  348  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
336 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
336 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
333 aa  348  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 
345 aa  348  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 
360 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 
335 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 
361 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.57 
 
 
352 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 
341 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
333 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
333 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.87 
 
 
356 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 
348 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
340 aa  347  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>