More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0575 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0575  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
331 aa  670    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.55 
 
 
348 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 
349 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 
346 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
348 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
346 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.55 
 
 
349 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 
345 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 
346 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
346 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
346 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 
346 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 
360 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 
347 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 
348 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 
342 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
347 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
338 aa  368  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.48 
 
 
342 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 
348 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
369 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 
335 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 
335 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
388 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 
329 aa  366  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 
352 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 
329 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.48 
 
 
339 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 
343 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 
335 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.81 
 
 
344 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 
348 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
359 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
356 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 
350 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
356 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 
357 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.75 
 
 
351 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.37 
 
 
336 aa  363  3e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 
341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.26 
 
 
336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 
348 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_002978  WD1112  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 
326 aa  361  1e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.729195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 
338 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
348 aa  358  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 
350 aa  358  5e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.88 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.76 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.97 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 
339 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.32 
 
 
344 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.05 
 
 
343 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.77 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.02 
 
 
357 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.02 
 
 
357 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
334 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.22 
 
 
345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
357 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 
336 aa  351  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
341 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.07 
 
 
354 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 
334 aa  350  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 
355 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.02 
 
 
333 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.53 
 
 
330 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.58 
 
 
334 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 
363 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.9 
 
 
355 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 
355 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.68 
 
 
338 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.19 
 
 
338 aa  348  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.58 
 
 
352 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
341 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
356 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
341 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.53 
 
 
337 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 
356 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.18 
 
 
361 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.58 
 
 
341 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.89 
 
 
334 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.18 
 
 
336 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 
338 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.94 
 
 
344 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.22 
 
 
343 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.89 
 
 
334 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.79 
 
 
321 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.58 
 
 
340 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.98 
 
 
337 aa  345  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.1 
 
 
334 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.87 
 
 
336 aa  345  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.31 
 
 
341 aa  345  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.4 
 
 
352 aa  345  6e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 
358 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.78 
 
 
348 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.66 
 
 
337 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.55 
 
 
327 aa  345  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.43 
 
 
351 aa  345  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.85 
 
 
346 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>