More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0471 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 343 aa  686    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.98 
 
 		 336 aa  537  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.72 
 
 		 338 aa  535  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.94 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0400  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.51 
 
 		 340 aa  502  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.55 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.84 
 
 		 335 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.84 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.04 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.24 
 
 		 335 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.07 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 356 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.44 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.03 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.97 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.19 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.44 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 		 336 aa  364  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.19 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.44 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.33 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.08 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.19 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.06 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 334 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.38 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.29 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.77 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.87 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.06 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 334 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 334 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.9 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.11 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.87 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.57 
 
 		 334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.57 
 
 		 334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 		 343 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>