More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0400 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0400  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 340 aa  685    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.53 
 
 		 338 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.37 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.51 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.26 
 
 		 335 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.96 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.67 
 
 		 335 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.15 
 
 		 336 aa  500  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.57 
 
 		 340 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.09 
 
 		 337 aa  497  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.8 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.98 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.92 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.63 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.13 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.13 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.63 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.33 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.97 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.41 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.67 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.19 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.67 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.79 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.06 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.96 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.67 
 
 		 345 aa  362  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.66 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.97 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 		 337 aa  360  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.12 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.83 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.7 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.85 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 344 aa  359  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.89 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.91 
 
 		 337 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.03 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 336 aa  358  7e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 336 aa  358  7e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 		 348 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.34 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.1 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.28 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 346 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.12 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.28 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.36 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.36 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.36 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.27 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.28 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.12 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>