286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1029 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1029  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
583 aa  1178    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.38 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  22.62 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  23.17 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  30.13 
 
 
567 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.91 
 
 
430 aa  65.1  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.06 
 
 
419 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.52 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  33.1 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  27.84 
 
 
477 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1329  AAA family ATPase  27.33 
 
 
587 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000361614  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 
493 aa  60.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  28.82 
 
 
451 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  28.24 
 
 
459 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  24.66 
 
 
327 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  33.91 
 
 
492 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  29.7 
 
 
534 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  33.91 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
424 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  33.83 
 
 
336 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  33.91 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  24.76 
 
 
428 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2102  AAA ATPase central domain protein  25.85 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  31.3 
 
 
488 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  30.7 
 
 
488 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  33.04 
 
 
496 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  23.8 
 
 
803 aa  54.3  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  24.56 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.59 
 
 
332 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  30.46 
 
 
424 aa  53.5  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  30.7 
 
 
488 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 
553 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  27.92 
 
 
327 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  27.92 
 
 
327 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.14 
 
 
742 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  24.51 
 
 
495 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  37.8 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  28.19 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  28.19 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  38.55 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  26.42 
 
 
389 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  25.59 
 
 
393 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  29.31 
 
 
425 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.3 
 
 
419 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  28 
 
 
405 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  30.48 
 
 
584 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.31 
 
 
685 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  24.9 
 
 
495 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  22.37 
 
 
371 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  22.37 
 
 
371 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  27.1 
 
 
663 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  24.44 
 
 
703 aa  50.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 
503 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  31.62 
 
 
501 aa  50.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.91 
 
 
517 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  31.25 
 
 
366 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  23.41 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  23.18 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.25 
 
 
617 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.59 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  31.37 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  23.79 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.31 
 
 
743 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.63 
 
 
738 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.62 
 
 
669 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  24.53 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  28.93 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  31.06 
 
 
325 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  25.68 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  28.24 
 
 
504 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  24.85 
 
 
1159 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  33.15 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2065  ATPase AAA-2 domain protein  55.81 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.812817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  26.29 
 
 
538 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  24.12 
 
 
521 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  24.65 
 
 
788 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  34.39 
 
 
715 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 
503 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  24.58 
 
 
327 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.23 
 
 
427 aa  48.9  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  27.72 
 
 
425 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  32.58 
 
 
503 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  32.58 
 
 
503 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  28.85 
 
 
451 aa  48.5  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  28.85 
 
 
450 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.92 
 
 
793 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  26.79 
 
 
412 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1071  putative cell division protease FtsH-like protein  27.1 
 
 
561 aa  48.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 
550 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
665 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  31.01 
 
 
352 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  25.9 
 
 
538 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  30.81 
 
 
683 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  24.63 
 
 
641 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.19 
 
 
804 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  22.51 
 
 
599 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>