More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1789 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  67.97 
 
 		 492 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  71.66 
 
 		 492 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  100 
 
 		 496 aa  987    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  67.97 
 
 		 492 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  82.86 
 
 		 496 aa  784    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  74.63 
 
 		 496 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  59.38 
 
 		 488 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  58.97 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  58.56 
 
 		 488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  58.35 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  51.94 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  51.33 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  48.57 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  51.31 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  48.67 
 
 		 503 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  47.65 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  48.65 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  48.65 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  45.51 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  46.11 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  45.27 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  46.11 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  44.47 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  42.83 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  40.32 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  39.68 
 
 		 503 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  40.93 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  43.18 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  39.59 
 
 		 504 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  40.5 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  41.5 
 
 		 550 aa  347  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  41.2 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  40.6 
 
 		 552 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  39.49 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  43.38 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  43.61 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  44.15 
 
 		 510 aa  319  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  36.08 
 
 		 492 aa  310  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  38.87 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  38.65 
 
 		 665 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  37.7 
 
 		 493 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  36.92 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  36.92 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  36.31 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  38.07 
 
 		 498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  35.85 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  35.85 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  35.89 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  38.43 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  35.77 
 
 		 503 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  35.55 
 
 		 495 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  35.81 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  37.14 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  36.36 
 
 		 490 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  43.54 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  35.89 
 
 		 491 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  43.3 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  33.68 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  35.92 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  35.5 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  42.58 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  36.44 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  34.23 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.65 
 
 		 500 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.97 
 
 		 491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  36.65 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  34.97 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  36.12 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.25 
 
 		 517 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  33.85 
 
 		 540 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.76 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  31.45 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  31.45 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  32.84 
 
 		 548 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  32.91 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  29.8 
 
 		 545 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  29.03 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.96 
 
 		 731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.96 
 
 		 731 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  35.21 
 
 		 632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.46 
 
 		 731 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 		 608 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  36.65 
 
 		 810 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  36.49 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  27.12 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  31.01 
 
 		 567 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.01 
 
 		 610 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.97 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  36.12 
 
 		 624 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 		 610 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  30.16 
 
 		 393 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.47 
 
 		 731 aa  123  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>