More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2804 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  75.41 
 
 		 489 aa  762    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  74.9 
 
 		 503 aa  793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  76.11 
 
 		 495 aa  785    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  75.1 
 
 		 503 aa  794    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  75.2 
 
 		 489 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  74.9 
 
 		 503 aa  794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  74.9 
 
 		 516 aa  793    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  75.46 
 
 		 489 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  73.27 
 
 		 491 aa  747    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  100 
 
 		 490 aa  1003    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  76.92 
 
 		 521 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  76.52 
 
 		 495 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  76.52 
 
 		 519 aa  804    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  52.24 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  50.61 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  51.12 
 
 		 493 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  51.32 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  51.62 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  44.13 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  48.59 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  40.57 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  39.96 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  39.96 
 
 		 512 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  37.02 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  37.04 
 
 		 503 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  37.4 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  36.44 
 
 		 503 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.27 
 
 		 550 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  35.63 
 
 		 503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  35.63 
 
 		 503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  36.79 
 
 		 552 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  36.83 
 
 		 503 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  37.22 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  36.7 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  35.93 
 
 		 504 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  37.83 
 
 		 537 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  36.71 
 
 		 512 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  36.48 
 
 		 503 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  35.17 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  37.6 
 
 		 492 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  37.4 
 
 		 492 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  36.25 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  36.46 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  36.86 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.7 
 
 		 488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  35.67 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  35.67 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  36.6 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  36.23 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  35.5 
 
 		 498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  35.61 
 
 		 503 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  34.48 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  35.11 
 
 		 545 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  35.96 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  34.89 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  36.36 
 
 		 496 aa  272  9e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 665 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  36.08 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  36.65 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  33.67 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  32.66 
 
 		 491 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  35.2 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.24 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  33.48 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  33.26 
 
 		 512 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 		 517 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.32 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  32.82 
 
 		 540 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  35.66 
 
 		 499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  35.4 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  35.61 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  33.74 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  31.54 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  27.37 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  30.33 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.07 
 
 		 800 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.96 
 
 		 754 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  36.1 
 
 		 471 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.94 
 
 		 781 aa  124  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.84 
 
 		 673 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.12 
 
 		 718 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  32.71 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  32.71 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.17 
 
 		 732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  32.14 
 
 		 540 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.02 
 
 		 784 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  30.51 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.77 
 
 		 754 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  35.45 
 
 		 407 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  32.8 
 
 		 533 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.91 
 
 		 775 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.03 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.62 
 
 		 757 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.86 
 
 		 730 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  34.39 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.79 
 
 		 731 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  34.39 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.96 
 
 		 759 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  26.53 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>