More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3939 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  991    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  83.33 
 
 		 493 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  83.54 
 
 		 493 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  54.55 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  53.57 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  53.37 
 
 		 503 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  53.37 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  55.78 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  53.37 
 
 		 516 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  53.46 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  52.82 
 
 		 521 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  52.82 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  53.23 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  52.03 
 
 		 489 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  52.24 
 
 		 490 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  53.33 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  51.12 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  52.97 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  49.4 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  48.49 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  44.72 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  43.9 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  44.11 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  39.15 
 
 		 503 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  38.31 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  40.49 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  38.57 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  37.53 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  37.42 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  38.79 
 
 		 552 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  36.34 
 
 		 553 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  38.24 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  38.57 
 
 		 495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  37.55 
 
 		 550 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  38.92 
 
 		 495 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  37.52 
 
 		 545 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  37.12 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 		 498 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.84 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 515 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  37.7 
 
 		 496 aa  289  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  38.28 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.09 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  37 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  34.71 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  37.55 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  35.83 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 		 504 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  34.26 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  34.18 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  33.94 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  35.37 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.95 
 
 		 510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  34.72 
 
 		 512 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  34.76 
 
 		 503 aa  272  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  34.68 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  34.56 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  34.56 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  35.09 
 
 		 665 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  36.73 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  37.06 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  35.59 
 
 		 507 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  38.92 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 		 517 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 		 517 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  40.87 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  40.62 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  40.62 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  39.18 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  35.02 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.83 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  33.26 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  30.81 
 
 		 534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.8 
 
 		 732 aa  136  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  47.06 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 		 718 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  36.21 
 
 		 548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  34.48 
 
 		 545 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.53 
 
 		 715 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.19 
 
 		 800 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.14 
 
 		 760 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  36.67 
 
 		 732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.44 
 
 		 781 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  33.58 
 
 		 803 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.63 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  35.93 
 
 		 775 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  37.44 
 
 		 718 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 		 731 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.99 
 
 		 731 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.11 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.18 
 
 		 784 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 731 aa  123  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.62 
 
 		 754 aa  123  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.38 
 
 		 540 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.08 
 
 		 768 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.36 
 
 		 781 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.48 
 
 		 730 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>