More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3041 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  76.25 
 
 
501 aa  767    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
492 aa  994    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  36.11 
 
 
512 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 
512 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  34.36 
 
 
553 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  35.52 
 
 
512 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  34.62 
 
 
503 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 
503 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  33.81 
 
 
504 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 
504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 
504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  33.73 
 
 
507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  32.92 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  31.45 
 
 
506 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  30.58 
 
 
503 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  30.58 
 
 
503 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  31.15 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  32.83 
 
 
515 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  33.75 
 
 
502 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
552 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  31.74 
 
 
537 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  34.36 
 
 
512 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  32.58 
 
 
550 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  29.96 
 
 
503 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  31.15 
 
 
492 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  31.15 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  32.97 
 
 
501 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  30.06 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  33.54 
 
 
493 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  33.68 
 
 
493 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  29.67 
 
 
488 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  29.61 
 
 
488 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  30.43 
 
 
503 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  29.81 
 
 
488 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  30.02 
 
 
492 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  31.66 
 
 
545 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 
510 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  31.39 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  30.36 
 
 
503 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  31.12 
 
 
503 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  28.78 
 
 
488 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  32.92 
 
 
493 aa  200  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  30.1 
 
 
519 aa  200  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  31.54 
 
 
490 aa  200  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 
503 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  30.85 
 
 
495 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  30.71 
 
 
516 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 
665 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  30.3 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  30.2 
 
 
512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  30.44 
 
 
521 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  30.86 
 
 
496 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  30.74 
 
 
517 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  31.3 
 
 
492 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  29.66 
 
 
512 aa  193  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  30.48 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  31.57 
 
 
509 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  30.5 
 
 
496 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  30.62 
 
 
497 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  28.6 
 
 
495 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.88 
 
 
517 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  29.46 
 
 
498 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  30.65 
 
 
489 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  31.01 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  30.21 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  36.28 
 
 
499 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  36.21 
 
 
499 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  36.21 
 
 
499 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  30.24 
 
 
495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  28.82 
 
 
491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  29.12 
 
 
540 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  28.74 
 
 
534 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  32.01 
 
 
499 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  33.81 
 
 
500 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  29.62 
 
 
471 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  34.15 
 
 
548 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  34.44 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  30.94 
 
 
567 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  26.72 
 
 
533 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.08 
 
 
540 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 
509 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 
509 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.51 
 
 
721 aa  103  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  30.8 
 
 
732 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.32 
 
 
784 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.33 
 
 
742 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.98 
 
 
701 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
800 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  32.97 
 
 
756 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
781 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.35 
 
 
736 aa  97.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.54 
 
 
737 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  29.58 
 
 
607 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  28.49 
 
 
754 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
781 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.64 
 
 
742 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.83 
 
 
756 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.54 
 
 
738 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.97 
 
 
723 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>