More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1620 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  70.45 
 
 		 504 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  73.16 
 
 		 507 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  72.45 
 
 		 503 aa  750    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  70.45 
 
 		 504 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  74.29 
 
 		 503 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  100 
 
 		 501 aa  1010    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  70.96 
 
 		 504 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  70.76 
 
 		 499 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  51.12 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  48.47 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  48.47 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  52.81 
 
 		 496 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  51.31 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  52.16 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  47.25 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  46.84 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  47.05 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  51.01 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  46.03 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  49.5 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  46.8 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  46.6 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  46.4 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  42.6 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  43.09 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  44.93 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  43.6 
 
 		 503 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  43.6 
 
 		 503 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  43.89 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  42.33 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  42.51 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  43.21 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  43 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  41.3 
 
 		 552 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  41.62 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  43.85 
 
 		 545 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  42.32 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  41.92 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  41.83 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  41.47 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  35.51 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  36.84 
 
 		 497 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.85 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  37.45 
 
 		 495 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  36.14 
 
 		 521 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 		 665 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  36.14 
 
 		 495 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  35.27 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  35.45 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  35.11 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  36.12 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  36.53 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  36.59 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  35.25 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  35.46 
 
 		 493 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  35.18 
 
 		 493 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  34.6 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  39.44 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  36.65 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 		 489 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  38.15 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.7 
 
 		 540 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  31.66 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  32.21 
 
 		 492 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  33.54 
 
 		 534 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  30.65 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  31.69 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  26.2 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  35.83 
 
 		 775 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.12 
 
 		 732 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.64 
 
 		 727 aa  127  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.53 
 
 		 713 aa  126  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 		 776 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.75 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.2 
 
 		 673 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.36 
 
 		 723 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.98 
 
 		 718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.8 
 
 		 800 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.15 
 
 		 753 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  28.37 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.34 
 
 		 731 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.63 
 
 		 737 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.31 
 
 		 781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.74 
 
 		 731 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  29.5 
 
 		 832 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 		 736 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.17 
 
 		 781 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.48 
 
 		 738 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>